Adesso non ci sono più dubbi Jonathas è un giocatore del Pescara. L'accordo è stato trovato verso l'ora di pranzo quando il Presidente Sebastiani, con Daniele Delli Carri, e la mediazione di Mino Raiola sono riusciti a chiudere l'affare. Un contratto definitivo, da 4 anni, per il nuovo attaccante di Stroppa.
Classe 1989, il 23 agosto 2006 esordisce nel Campeonato Brasileiro Série A nella partita Botafogo-Cruzeiro 1-0. In totale nella sua prima stagione con Les Renards gioca 6 partite.
La stagione successiva gioca in prestito nel Campeonato Brasileiro Série B con l'Ipatinga (5 presenze).
Nel 2008 viene ceduto in prestito al Vila Nova ma viene quasi subito richiamato al Cruzeiro a causa di vari infortuni che colpiscono la squadra di Belo Horizonte.
Nel Ottobre 2008 l' AZ Alkmaar ne acquista il 65% del cartellino per 600.000 euro.
Jonathas nella sua prima stagione in Olanda viene impiegato solo nella formazione giovanile della squadra di Alkmaar; dalla stagione 2009-2010 fa parte della prima squadra debuttando ufficialmente il 28 ottobre 2009 nella partita di Coppa d'Olanda contro lo Spakenburg, nella quale sigla il gol del momentaneo 4-2.
In Eredivisie debutta invece il 21 novembre nella sfida con il Roda JC (vinta 4-2), dove segna il suo primo gol in campionato, ma subisce anche la sua prima espulsione; conclude la sua prima stagione con l' AZ collezionando in totale 6 partite e 2 gol (4 in Eredivisie e 2 in Coppa d'Olanda).
Nella stagione seguente gioca 11 partite di Eredivisie (con 3 gol), 4 di Europa League e 1 di Coppa d'Olanda (con 2 gol).
Il 31 gennaio 2011 passa in prestito alla squadra italiana del Brescia.
Esordisce nel campionato italiano il successivo 20 marzo in Juventus-Brescia (2-1), subentrando al 77° minuto ad Alessandro Diamanti. A fine stagione la squadra retrocede in Serie B e lui colleziona appena 6 presenze.
Nel luglio 2011 il prestito viene rinnovato per un' altra stagione: segna il suo primo gol con la maglia delle rondinelle il 13 agosto 2011 contro l'Aquila, partita valida per la Coppa Italia 2011-2012; segna anche al debutto in Serie B, il 27 agosto nella vittoria per 2-0 contro il Vicenza. La sua prima doppietta è datata 11 febbraio 2012 nella partita Cittadella-Brescia 0-2.
Conclude la stagione totalizzando 33 presenze, 16 gol e 7 assist in Serie B e 2 presenze e 2 gol in Coppa Italia.
Daniele Polidoro